O sistema de reputação foi desenvolvido para definir uma fama positiva ou negativa em todo o mundo ninja ganhando respeito e podendo mudar o seu tratamento referente aos NPCs durante as missões e afins.

Todas as suas ações que tenham pequena repercussão, assassinatos, missões, entre outros diversos acabaram por gerar uma mudança em sua Reputação ao fim da sua aventura, o narrador deve definir os pontos positivos ou negativos e entregar uma pontuação entre 1 a 20 para positivo ou para negativo afetando assim o resto de sua jogatina.

Você ganha alguns direitos tendo determinada reputação fora isso, como cita a seguinte tabela;

Positivo:
Reputação 0 - Neutro, sem reconhecimento - Pode fazer exames para ingressar em academias e tornar-se ninja assim como se tornar capanga de qualquer milícia existente com permissão de seu líder.
Reputação +20 - Ajudante, reconhecido como um ninja exemplar ou cidadão - pode integrar uma equipe para executar missões ou ordens superiores.
Reputação +50 - Guerreiro, reconhecido como um poderoso ninja de sua vila. - Pode líderar equipes de até 2 ninjas para missões sob ordens de um ninja de cargo mais alto.
Reputação +100 - Heroi, reconhecido como um ninja capaz de feitos incríveis por sua vila sendo querido por todos. - Pode dar ordens a ninjas de cargo mais baixo, liderando-os sem precisar de ordens de superiores, por ser considerado um dos mais aptos.
Reputação +150 - Guardião, reconhecido como um dos mais habilidosos ninjas em seu meio digno de ser guarda-costas de um Kage. - Ganha direitos políticos, pode participar de reuniões e se tornar braço direito do Kage. Em ocasiões de perigo, guerra, ou similares pode dar ordens em todo e qualquer civil ou ninja de cargo inferior assim como líderar tropas sem limites.
Reputação +200 - A sombra sobre o mundo, reconhecido como um ninja de nível kage - Pode criar a sua própria vila, é conhecido mundialmente e seu nome é digno de respeito em qualquer lugar que vá.

Negativo:
Reputação 0 - Neutro, sem reconhecimento - Pode fazer exames para ingressar em academias e tornar-se ninja assim como se tornar capanga de qualquer milícia existente com permissão de seu líder.
Reputação -20 - Capanga, reconhecido como bandido ou mal caráter. - Pode fazer trabalhos para sua milícia ou para si com até 2 seguidores sob suas ordens.
Reputação -50 - Ladino, reconhecido como enganador ou bandido astuto. - Pode criar pequenas gangues e liderar até 5 bandidos em trabalhos e similares.
Reputação -100 - Magnata, um temido mal feitor conhecido pelo mundo. - Pode líderar grupos de até 30 bandidos, seu nome é temido e repudiado pelo mundo ninja pelos seus atos.
Reputação -150 - Monstro, reconhecido pelo mundo ninja como alguém impiedoso. - Desperta interesse de todas as grandes milícias e até mesmos as menores gangues o temem, pode obter cargos altos dentro das milicias e organizações e pode liderar grandes grupos de bandidos agora sem limites.
Reputação -200 - Demônio, reconhecido por todo o mundo como alguém capaz de coisas inacreditáveis. - Pode criar sua própria milícia, temido cegamente por todo o mundo ninja as pessoas lhe veem como uma criatura desprovida de emoções.